中华预防医学杂志    2020年03期 新型冠状病毒基因组与流行病学研究:病毒起源与受体结合的线索    PDF     文章点击量:356    
中华预防医学杂志2020年03期
中华医学会主办。
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张益
新型冠状病毒基因组与流行病学研究:病毒起源与受体结合的线索
中华预防医学杂志, 2020,54(3)
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2020.03.102
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新型冠状病毒基因组与流行病学研究:病毒起源与受体结合的线索
张益     
张益 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
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Sanger测序、Illumina二代测序与Oxford纳米孔测序均被用于新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组研究。对9例住院患者(8例到过华南海鲜市场)的肺泡灌洗液样本和培养分离株进行测序,获得了病毒全长基因组序列,得到的9株病毒基因组序列同源性高达99.98%(提示短时间内同一来源),与2018年在舟山发现的两种蝙蝠冠状病毒ZC45和ZXC21同源性较高,达到了88%,与SARS-CoV和MERS-CoV同源性分别为79%和50%,亲缘关系较远。进化分析显示,2019-nCoV属于Betacoronavirus属、Sarbecovirus亚属。2019-nCoV受体结合结构域与SARS-CoV相似,仅个别关键位点存在氨基酸变异,提示与SARS-CoV同为使用ACE2受体进入人体,但结合能力需进一步研究。关于新型冠状病毒的起源,有很大几率来源于蝙蝠,随后由中间宿主传播给人类,该中间宿主应该为华南海鲜市场所贩卖的一种野生动物,具体未知。与2019-nCoV相比,蝙蝠冠状病毒具有更为复杂的重组情况和更高的重组概率,提示新型冠状病毒不太可能是由偶然突变而来,确切来源和传播途径需进一步研究。而新型冠状病毒与蝙蝠来源的冠状病毒同源度不到90%,提示蝙蝠冠状病毒可能并非2019-nCoV的直接祖先。从SARS和MERS的经验来看,蝙蝠都是病毒的天然宿主,但是由另一种动物充当了传播途径中的中间宿主。本次疫情的暴发更加凸显野生动物体内病毒库对人类潜在的威胁。

参考文献